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现在国内生物安全柜大量应用在卫生、疾病预防控制、保健和食品卫生等领域和实验室级研究机构，在生物制药、环境监测、科研机构也有应用，至今生物安全柜的在用量约2万台。在初期，主要解决的还是填补空白，满足用户需求的问题，并未对生物安全柜用户使用中的安全维护引起足够的重视。作为绝大部分制造商，其工作重点在于产量和市场，并没有很好地开展现场安装检验和使用期间的维护检验;作为使用单位，由于对产品结构和防护原理知识的缺乏，没有安装验收和期间维护检查的安全防护意识，认为使用了安全柜就安全了，一劳永逸。
从防止微生物气溶胶污染的保护能力上看，Al、A2、Bl和B2四种类型生物安全柜是相同的。由于B1和B2型生物安全柜是直接将气流排出实验室外，则对在实验过程中产生有毒气体时，显示出它们的优势。一方面，毒性气体可以完全排出实验室而防止对实验人员的危害，特别是B2型生物安全柜没有气体在柜体内循环，还可以避免实验中产生的对实验有影响的气体循环进入实验区。目前广泛使用的是Ⅱ级A2型和B2型生物安全柜。
对产品安装检验、维护检验及周期检验技术指标不了解，自身没有确认能力，也没有委托第三方有资质检验机构测试的意识。
机构是生物安全柜使用的主体，由于缺乏安全防护制度和法规意识上的缺乏，甚至会使用无注册证的生物安全柜，更不用说对产品技术指标上的掌控，无法保障实验室的安全。中国食品药品网曾曝光，
食品药品监督管理局一举查获了两起使用无产品注册证生物安全柜案件，两家大型机构用于病检查的仪器竞无《产品注册证》，经查，一家医院无法提供生物安全柜的《产品注册证》，另一家医院生物安全柜的《产品注册证》系。安丘市食品药品监督管理局依法对两家医院进行了处罚并展开进一步追查。
(1)Ⅱ级A型生物安全柜
Ⅱ级A型生物安全柜有1个内置风机将实验室空气以0．38 m／s的速率吸入安全柜，通过HEPA滤器后向下，在距工作台表面6．18 cm处分开，一半通过前面的排风格栅，另一半通过后面的排风格栅。所有实验中产生的气溶胶或液滴均被向下气流带走。气流经排出通道到达安全柜顶部的2个HEPA滤器之间，此时，约70％的气体经供风HEPA过滤器重新返回柜内操作区域被再利用，其余30％的气体经排风过滤器后被排到实验室再反复利用，或通过建筑物的排风系统排到外界。